Vợ ông là Châu Thị Ngọc Lương. Hồ Đắc Trung có 6 người con trai và 4 người con gái:

• Hồ Đắc Khải, Tổng đốc thời Bảo Đại
• Hồ Đắc Ân, tiến sĩ ngành dược
• Hồ Đắc Di, bác sĩ, hiệu trưởng đầu tiên của Đại học Y khoa Hà Nội
• Hồ Đắc Lân, kỹ sư công nghiệp
• Hồ Đắc Điềm, tiến sĩ ngành luật
• Hồ Đắc Thứ

• Hồ Thị Chỉ, Nhất giai ân phi thời Khải Định
• Hồ Thị Hạnh, xuất gia, pháp danh Diệu Không
• Hồ Thị Phương
• Hồ Thị Huyên, lấy Thượng thư Bộ Công Nguyễn Phúc Ưng Úy, mẹ của Giáo sư hoá học Nguyễn Phúc Bửu Hội, sau xuất gia lấy tên là Diệu Huệ.